Наша общая цель — выявить молекулярные механизмы, посредством которых белки выполняют свои жизненно важные функции. В первую очередь нас интересует понимание молекулярного механизма долговременной памяти и роли в ней функциональных амилоидов. Мы также заинтересованы в понимании ключевых различий между токсичными и функциональными амилоидами и механизмами их образования. Для решения вышеупомянутых вопросов мы используем эксперименты по силовой спектроскопии одиночных молекул, моделирование молекулярной динамики, теоретическое моделирование и передовые алгоритмы машинного обучения.
L. M. Cortez, A. J. Morrison, C. R. Garen, S. Patterson, T. Uyesugi, R. Petrosyan, R. V. Sekar, M. J. Harms*, M. T. Woodside*, and V. L. Sim*
“Probing the origin of prion protein misfolding via reconstruction of ancestral proteins”
Protein Sci. (2022) 31 (12) e4477.
R. Petrosyan, A. Narayan, and M. T. Woodside
“Single-molecule force spectroscopy of protein folding”
J. Mol. Biol. (2021) 433 (20), 167207.
R. Petrosyan, S. Patra, N. Rezajooei, C. Garen, and M.T. Woodside*
“Unfolded and intermediate states of PrP play a key role in the mechanism of action of an antiprion chaperone”
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. (2021) 118 (9), e2010213118.
R. Petrosyan*
“Unfolding force definition and the unified model for the mean unfolding force dependence on the loading rate”
J. Stat. Mech.: Theory Exp. (2020) (3), 033201.
D.A.N. Foster, R. Petrosyan, A.G.T. Pyo, A. Hoffmann, F. Wang, and M.T. Woodside*
“Probing position-dependent diffusion in folding reactions using single-molecule force spectroscopy”
Biophys. J. (2018) 114 (7), 1657-1666.
R. Petrosyan*
“Improved approximations for some polymer extension models”
Rheol. Acta (2017) 56 (1), 21-26.
R. Petrosyan, C.A. Bippes, S. Walheim, D. Harder, D. Fotiadis, T. Schimmel, D. Alsteens, and D.J. Müller*
“Single-molecule force spectroscopy of membrane proteins from membranes freely spanning across nanoscopic
pores”, Nano Lett. (2015) 15 (5), 3624-3633.
E.P. Petrov*, R. Petrosyan, and P. Schwille
“Translational and rotational diffusion of micrometer-sized solid domains in lipid membranes”
Soft Matter (2012) 8 (29), 7552-7555.